食用葵花籽油的副作用之一就是可能会引起心肌病变。假如给动物大量摄入葵花籽油，会使它们的动作迟缓，并造成发育不良的现象。

除此之外，葵花籽油中含有某种物质具有抑制睾丸成分，如果男性食用太多，可能会引发睾丸萎缩，从而造成不育。所以建议青壮年男性不宜多食葵花籽油。